MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp7

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021979	ATG	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218777
2	NC_021979	CTGGAA	2	12	112	123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529218777
3	NC_021979	T	6	6	139	144	0 %	100 %	0 %	0 %	529218777
4	NC_021979	GC	3	6	149	154	0 %	0 %	50 %	50 %	529218777
5	NC_021979	GTT	2	6	259	264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218777
6	NC_021979	TGC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218777
7	NC_021979	T	6	6	314	319	0 %	100 %	0 %	0 %	529218777
8	NC_021979	AATC	2	8	459	466	50 %	25 %	0 %	25 %	529218777
9	NC_021979	CCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218777
10	NC_021979	TCA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218777
11	NC_021979	CACGC	2	10	649	658	20 %	0 %	20 %	60 %	529218777
12	NC_021979	CAA	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218777
13	NC_021979	TCACC	2	10	729	738	20 %	20 %	0 %	60 %	529218777
14	NC_021979	ATC	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021979	TTG	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021979	GAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021979	A	9	9	1099	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021979	CTA	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218779
19	NC_021979	A	6	6	1185	1190	100 %	0 %	0 %	0 %	529218779
20	NC_021979	TTC	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218779
21	NC_021979	TAA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218779
22	NC_021979	TGG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
23	NC_021979	TTG	3	9	1353	1361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218779
24	NC_021979	GTG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
25	NC_021979	TAT	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218779
26	NC_021979	AGG	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218779
27	NC_021979	TGG	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
28	NC_021979	TAC	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218779
29	NC_021979	TGG	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
30	NC_021979	TCGG	2	8	1510	1517	0 %	25 %	50 %	25 %	529218779
31	NC_021979	GTG	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
32	NC_021979	GGC	2	6	1610	1615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218779
33	NC_021979	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	529218779
34	NC_021979	TGG	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
35	NC_021979	TGG	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
36	NC_021979	TGT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218779
37	NC_021979	TGG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
38	NC_021979	GTG	2	6	1845	1850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
39	NC_021979	TGC	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218779
40	NC_021979	TAG	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218779
41	NC_021979	GGA	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218779
42	NC_021979	TAT	2	6	1909	1914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218779
43	NC_021979	TGG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
44	NC_021979	GATTG	2	10	1930	1939	20 %	40 %	40 %	0 %	529218779
45	NC_021979	TTA	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218779
46	NC_021979	AGG	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218779
47	NC_021979	TAA	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218779
48	NC_021979	TGG	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
49	NC_021979	CAA	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218779
50	NC_021979	GTG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
51	NC_021979	GGTT	2	8	2091	2098	0 %	50 %	50 %	0 %	529218779
52	NC_021979	GCA	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218779
53	NC_021979	AAT	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218779
54	NC_021979	TGG	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
55	NC_021979	TGG	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
56	NC_021979	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218779
57	NC_021979	TCTGG	2	10	2225	2234	0 %	40 %	40 %	20 %	529218779
58	NC_021979	AGCC	2	8	2279	2286	25 %	0 %	25 %	50 %	529218779
59	NC_021979	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218779
60	NC_021979	A	6	6	2416	2421	100 %	0 %	0 %	0 %	529218779
61	NC_021979	GAT	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218779
62	NC_021979	TGG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218779
63	NC_021979	GTTT	2	8	2471	2478	0 %	75 %	25 %	0 %	529218779
64	NC_021979	TAG	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218779
65	NC_021979	TTG	2	6	2550	2555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218779
66	NC_021979	GAT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218779
67	NC_021979	CCG	2	6	2581	2586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218779
68	NC_021979	CGG	2	6	2715	2720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218779
69	NC_021979	TCT	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218779
70	NC_021979	ACT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218779
71	NC_021979	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218779
72	NC_021979	TCA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218779
73	NC_021979	ATCT	2	8	2949	2956	25 %	50 %	0 %	25 %	529218779
74	NC_021979	GCC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218779
75	NC_021979	CT	3	6	3006	3011	0 %	50 %	0 %	50 %	529218779
76	NC_021979	ACGA	2	8	3077	3084	50 %	0 %	25 %	25 %	529218779
77	NC_021979	AAC	2	6	3140	3145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218779
78	NC_021979	GCC	2	6	3207	3212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218779
79	NC_021979	TGTGA	2	10	3215	3224	20 %	40 %	40 %	0 %	529218779
80	NC_021979	CGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218779
81	NC_021979	GACC	2	8	3310	3317	25 %	0 %	25 %	50 %	529218779
82	NC_021979	GCT	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218779
83	NC_021979	GCA	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218779
84	NC_021979	AACGA	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	529218779
85	NC_021979	CTG	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021979	T	6	6	3571	3576	0 %	100 %	0 %	0 %	529218780
87	NC_021979	GA	3	6	3734	3739	50 %	0 %	50 %	0 %	529218780
88	NC_021979	TCC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218780
89	NC_021979	C	6	6	3802	3807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_021979	CTGA	2	8	3823	3830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021979	GCT	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.